九三学社青岛社员、山东省海洋经济文化研究院副研究员刘康说：自上世纪80年代开始，我国的海洋保护区建设稳步推进。截至2016年底，全国已初步形成了覆盖东南沿海，类型齐全、形式多样的海洋保护区体系。但由于缺乏顶层设计，我国的海洋保护区建设还存在一些问题，亟需从体制机制创新上加以解决。主要问题有：
一是海洋保护区管理存在部门冲突。目前，现有的35个国家级海洋自然保护区中，属于海洋部门管理的有12个，林业11个、环保7个，渔业（农业）5个。海洋保护区建设与管理的主体是海洋主管部门，但环保、林业和农业部下属的渔业部门也占有相当比重，由于保护重点、管理模式和资金投入的差异，管理目标和保护定位存在冲突，主要矛盾集中在海洋自然保护区的建设与管理层面。
二是海洋保护区建设地区差异显著。从目前发展来看，海洋自然保护区分布相对均衡，代表性海洋自然与文化遗产丰富的广东、辽宁、山东、福建、海南5省相对领先，其他各地也均有分布；海洋特别保护区和水产种质资源保护区建设地区差异明显，山东省优势明显，辽宁、广东、福建、浙江紧随其后，其他地区则落后较多。
三是海洋保护区建设定位有待优化。近年来，海洋公园和海洋水产种质资源保护区成为海洋保护区建设的主体，海洋保护区功能定位由严格的自然保护区向兼顾保护与发展的特别保护区转型，但出现了名义保护、实为开发的保护区建设倾向，海洋生态保护能力严重不足，从根本上偏离了海洋保护区建设的目的。
四是海洋保护区建设机制有待创新。海洋保护区选址与建设缺乏整体设计和系统规划，建设模式与发展规模基本取决于地方政府的意愿，导致很多重要的代表性自然与文化遗产得不到有效保护，而部分没有保护价值或保护成效不大的保护区却得到高额投入。
五是海洋国家公园建设存在空白。国家出台多份文件提出建立国家公园体制的具体要求，但目前，进入国家公园建设试点的9个国家公园均为陆地保护地，没有一个海洋类型的国家公园建设进入试点或规划。
为此，建议：
一、改革海洋保护区管理体制。建立国家海洋主体功能区划、省市海洋功能区划和县区海域使用规划三级海洋空间规划体系。完善海洋生态红线制度，明确各类海洋保护区与海洋生态敏感区、生态脆弱区的关系。建立由海洋与渔业主管部门为核心的海洋保护区建设与管理体制，环保及国土等部门逐步退出海洋保护区管理体系。研究制定《海洋保护区法》，建立国家和省市2级海洋保护区管理体制，明确海洋保护区建设的主体和管理制度。
二、创新海洋保护区建设机制。建立自上而下的海洋保护区建设机制，在国家层面确定海洋保护区建设的规模、类型和空间分布格局，有效减少地方利益对海洋保护区建设的干扰。拓展海洋保护区建设资金来源，依托国家海域使用金及区域生态补偿资金，建立国家海洋保护区建设基金。创新海洋保护区运营模式，探索建立特许经营、社会捐赠和志愿参与制度。
三、完善海洋保护区构成体系。调整国内海洋保护区建设类型，逐步构建以海洋国家公园为核心，海洋自然保护区、海洋特别保护区及国家海岸公园为支撑的海洋保护区体系。建立由海洋生态特别保护区、海洋资源特别保护区、海洋景观特别保护区及海洋文化遗产特别保护区等组成的国家海洋特别保护区架构，将国家级海洋公园从海洋特别保护区中分离，并更名为国家海岸或国家海滨公园，突出国民游憩和资源可持续利用属性。
四、加快推进海洋国家公园建设。结合国家海洋主体功能区划评估与海洋生态红线建设，对现有的各类海洋保护区进行全面评估，确立具有国家代表性和生态重要性的海洋自然与文化遗产保护区，并按照海区择优选择2-3处进行海洋国家公园建设试点。选址要突出保护优先、全民公益的属性，重点从现有的国家级海洋自然保护区中进行选择，可以适度考虑与周边的海洋特别保护区及其他类型的海洋保护区进行整合。
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